Sekce dohledu nad finančním trhem II bude mít nově pět odborů, což je o dva více než doposud:
- odbor dohledu a kontroly poskytovatelů spotřebitelských úvěrů,
- odbor dohledu a kontroly poskytovatelů platebních služeb a směnárníků,
- odbor dohledu nad distribucí finančních produktů,
- odbor kontroly distribuce finančních produktů,
- odbor dohledu a kontroly kapitálového trhu.
V souvislosti s výše uvedeným se přesouvají některé kompetence mezi sekcí dohledu nad finančním trhem a sekcí dohledu nad finančním trhem II. Výsledným stavem bude takové uspořádání, ve kterém každá z těchto sekcí bude dohlížet na dodržování povinností dle zákona o ochraně spotřebitele a zákona o některých opatřeních proti legalizaci výnosů z trestné činnosti a financování terorismu u subjektů, nad nimiž vykonává dohled. V rámci uvedených změn dochází v sekci dohledu nad finančním trhem II také ke sjednocení dohledu nad investičními společnostmi a fondy.